Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PGDP52209 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PGDP52209 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PGDP52209 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGDP52209 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGDP52209 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGDP52209 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PGDP52209 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGDP52209 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGDP52209 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGDP52209 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGDP52209 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGDP52209 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PGDP52209 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGDP52209 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGDP52209 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGDP52209 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGDP52209 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PGDP52209 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGDP52209 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PGDP52209 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGDP52209 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGDP52209 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGDP52209 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGDP52209 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGDP52209 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGDP52209 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PGDP52209 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PGDP52209 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGDP52209 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGDP52209 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGDP52209 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGDP52209 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PGDP52209 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PGDP52209 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PGDP52209 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PGDP52209 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PGDP52209 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGDP52209 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGDP52209 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGDP52209 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGDP52209 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGDP52209 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGDP52209 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGDP52209 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGDP52209 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGDP52209 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGDP52209 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGDP52209 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGDP52209 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGDP52209 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGDP52209 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGDP52209 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PGDP52209 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGDP52209 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGDP52209 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PGDP52209 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGDP52209 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGDP52209 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGDP52209 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGDP52209 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGDP52209 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGDP52209 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGDP52209 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGDP52209 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGDP52209 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGDP52209 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGDP52209 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGDP52209 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGDP52209 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGDP52209 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGDP52209 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGDP52209 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGDP52209 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGDP52209 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGDP52209 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGDP52209 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGDP52209 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGDP52209 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGDP52209 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGDP52209 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGDP52209 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGDP52209 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms