Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPFP49454 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPFP49454 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPFP49454 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPFP49454 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPFP49454 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPFP49454 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPFP49454 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPFP49454 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPFP49454 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPFP49454 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPFP49454 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPFP49454 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPFP49454 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPFP49454 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPFP49454 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPFP49454 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPFP49454 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPFP49454 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPFP49454 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPFP49454 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPFP49454 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPFP49454 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPFP49454 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPFP49454 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPFP49454 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPFP49454 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPFP49454 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPFP49454 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPFP49454 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPFP49454 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPFP49454 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPFP49454 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPFP49454 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPFP49454 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPFP49454 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPFP49454 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPFP49454 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPFP49454 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPFP49454 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPFP49454 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPFP49454 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPFP49454 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPFP49454 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPFP49454 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPFP49454 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPFP49454 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPFP49454 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPFP49454 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPFP49454 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPFP49454 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPFP49454 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPFP49454 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPFP49454 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPFP49454 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPFP49454 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPFP49454 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPFP49454 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPFP49454 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPFP49454 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPFP49454 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPFP49454 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPFP49454 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPFP49454 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPFP49454 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPFP49454 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPFP49454 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPFP49454 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPFP49454 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPFP49454 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPFP49454 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPFP49454 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPFP49454 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPFP49454 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPFP49454 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPFP49454 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPFP49454 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPFP49454 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPFP49454 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPFP49454 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPFP49454 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPFP49454 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPFP49454 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPFP49454 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPFP49454 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPFP49454 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPFP49454 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPFP49454 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPFP49454 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPFP49454 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPFP49454 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPFP49454 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPFP49454 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPFP49454 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPFP49454 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPFP49454 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPFP49454 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPFP49454 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPFP49454 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPFP49454 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms