Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTFRP26992 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms