Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2AP24928 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2AP24928 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2AP24928 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms