Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNCP24863 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNCP24863 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNCP24863 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNCP24863 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNCP24863 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNCP24863 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNCP24863 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNCP24863 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNCP24863 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNCP24863 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNCP24863 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNCP24863 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNCP24863 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNCP24863 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNCP24863 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNCP24863 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNCP24863 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNCP24863 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNCP24863 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNCP24863 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNCP24863 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNCP24863 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCNCP24863 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNCP24863 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNCP24863 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNCP24863 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNCP24863 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNCP24863 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNCP24863 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNCP24863 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNCP24863 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNCP24863 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNCP24863 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNCP24863 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNCP24863 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNCP24863 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNCP24863 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNCP24863 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNCP24863 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNCP24863 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNCP24863 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNCP24863 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNCP24863 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNCP24863 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNCP24863 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNCP24863 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNCP24863 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNCP24863 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNCP24863 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNCP24863 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNCP24863 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNCP24863 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNCP24863 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNCP24863 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNCP24863 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNCP24863 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNCP24863 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNCP24863 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNCP24863 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNCP24863 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNCP24863 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNCP24863 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNCP24863 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNCP24863 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNCP24863 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNCP24863 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNCP24863 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNCP24863 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNCP24863 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNCP24863 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNCP24863 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNCP24863 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNCP24863 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNCP24863 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNCP24863 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNCP24863 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNCP24863 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNCP24863 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNCP24863 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNCP24863 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNCP24863 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNCP24863 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNCP24863 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNCP24863 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNCP24863 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNCP24863 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNCP24863 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNCP24863 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNCP24863 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNCP24863 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNCP24863 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNCP24863 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNCP24863 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNCP24863 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNCP24863 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNCP24863 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNCP24863 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNCP24863 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNCP24863 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms