Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL9A1P20849 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL9A1P20849 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms