Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TSPAN8P19075 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN8P19075 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms