Protein–RNA interactions for Protein: P13671

C6, Complement component C6, humanhuman

Predictions only

Length 934 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6P13671 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6P13671 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6P13671 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C6P13671 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C6P13671 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6P13671 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6P13671 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6P13671 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6P13671 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6P13671 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6P13671 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6P13671 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6P13671 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6P13671 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6P13671 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6P13671 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6P13671 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6P13671 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6P13671 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6P13671 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C6P13671 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C6P13671 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C6P13671 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C6P13671 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6P13671 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6P13671 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6P13671 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6P13671 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6P13671 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6P13671 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6P13671 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6P13671 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6P13671 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6P13671 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6P13671 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6P13671 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6P13671 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6P13671 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6P13671 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6P13671 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C6P13671 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6P13671 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C6P13671 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C6P13671 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C6P13671 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C6P13671 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C6P13671 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6P13671 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6P13671 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6P13671 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6P13671 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C6P13671 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6P13671 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6P13671 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6P13671 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C6P13671 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6P13671 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6P13671 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6P13671 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6P13671 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6P13671 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6P13671 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6P13671 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C6P13671 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6P13671 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C6P13671 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6P13671 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6P13671 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6P13671 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6P13671 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6P13671 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6P13671 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C6P13671 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6P13671 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6P13671 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6P13671 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6P13671 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6P13671 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6P13671 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6P13671 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6P13671 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6P13671 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6P13671 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6P13671 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C6P13671 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6P13671 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6P13671 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6P13671 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6P13671 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6P13671 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6P13671 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C6P13671 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6P13671 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6P13671 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C6P13671 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6P13671 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6P13671 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6P13671 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6P13671 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6P13671 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms