Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK4P11802 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK4P11802 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK4P11802 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK4P11802 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK4P11802 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK4P11802 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK4P11802 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK4P11802 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK4P11802 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK4P11802 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK4P11802 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK4P11802 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK4P11802 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK4P11802 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK4P11802 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK4P11802 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK4P11802 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK4P11802 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK4P11802 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK4P11802 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK4P11802 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK4P11802 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK4P11802 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK4P11802 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK4P11802 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK4P11802 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK4P11802 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK4P11802 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK4P11802 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK4P11802 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK4P11802 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK4P11802 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK4P11802 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK4P11802 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK4P11802 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK4P11802 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK4P11802 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK4P11802 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK4P11802 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK4P11802 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK4P11802 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK4P11802 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK4P11802 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK4P11802 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK4P11802 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK4P11802 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK4P11802 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK4P11802 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK4P11802 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK4P11802 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK4P11802 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK4P11802 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK4P11802 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK4P11802 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK4P11802 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK4P11802 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK4P11802 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK4P11802 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK4P11802 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK4P11802 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK4P11802 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK4P11802 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK4P11802 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK4P11802 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK4P11802 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK4P11802 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK4P11802 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK4P11802 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK4P11802 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK4P11802 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK4P11802 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK4P11802 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK4P11802 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK4P11802 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK4P11802 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK4P11802 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK4P11802 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK4P11802 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK4P11802 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK4P11802 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK4P11802 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK4P11802 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK4P11802 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK4P11802 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK4P11802 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK4P11802 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK4P11802 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK4P11802 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK4P11802 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK4P11802 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK4P11802 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK4P11802 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK4P11802 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK4P11802 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK4P11802 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK4P11802 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK4P11802 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK4P11802 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK4P11802 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms