Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRUB2O95900 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 319.4 ms