Protein–RNA interactions for Protein: O95394

PGM3, Phosphoacetylglucosamine mutase, humanhuman

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM3O95394 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM3O95394 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM3O95394 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM3O95394 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM3O95394 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM3O95394 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM3O95394 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM3O95394 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM3O95394 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM3O95394 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM3O95394 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM3O95394 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM3O95394 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM3O95394 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM3O95394 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM3O95394 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM3O95394 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM3O95394 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM3O95394 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM3O95394 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM3O95394 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM3O95394 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM3O95394 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM3O95394 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM3O95394 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM3O95394 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM3O95394 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM3O95394 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM3O95394 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM3O95394 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM3O95394 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM3O95394 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM3O95394 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM3O95394 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM3O95394 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM3O95394 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM3O95394 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM3O95394 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM3O95394 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM3O95394 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM3O95394 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGM3O95394 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGM3O95394 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM3O95394 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM3O95394 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM3O95394 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM3O95394 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM3O95394 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM3O95394 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM3O95394 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM3O95394 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM3O95394 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM3O95394 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM3O95394 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGM3O95394 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGM3O95394 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGM3O95394 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGM3O95394 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGM3O95394 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PGM3O95394 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGM3O95394 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGM3O95394 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGM3O95394 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PGM3O95394 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGM3O95394 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGM3O95394 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGM3O95394 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGM3O95394 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PGM3O95394 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGM3O95394 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGM3O95394 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGM3O95394 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGM3O95394 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGM3O95394 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGM3O95394 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGM3O95394 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGM3O95394 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGM3O95394 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGM3O95394 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGM3O95394 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGM3O95394 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGM3O95394 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGM3O95394 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms