Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQF6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQF6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQF6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQF6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQF6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQF6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQF6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQF6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQF6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQF6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQF6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQF6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQF6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQF6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQF6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQF6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQF6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQF6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQF6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQF6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQF6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQF6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQF6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQF6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQF6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BQF6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQF6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQF6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQF6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQF6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQF6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQF6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQF6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQF6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQF6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQF6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQF6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQF6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQF6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BQF6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQF6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQF6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQF6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQF6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQF6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQF6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQF6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BQF6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BQF6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQF6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQF6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQF6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQF6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQF6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQF6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQF6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BQF6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQF6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQF6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQF6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQF6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQF6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQF6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms