Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNC9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNC9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNC9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNC9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNC9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNC9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNC9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNC9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNC9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNC9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNC9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNC9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNC9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNC9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNC9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNC9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNC9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNC9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNC9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNC9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNC9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNC9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNC9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNC9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNC9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNC9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNC9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H3BNC9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BNC9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BNC9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BNC9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BNC9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNC9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNC9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNC9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNC9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNC9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNC9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNC9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNC9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNC9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNC9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNC9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNC9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNC9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNC9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNC9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNC9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNC9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNC9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNC9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNC9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNC9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNC9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNC9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNC9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNC9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNC9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNC9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNC9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNC9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNC9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNC9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNC9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNC9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNC9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNC9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNC9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNC9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNC9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNC9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNC9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNC9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNC9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNC9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNC9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BNC9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BNC9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BNC9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BNC9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BNC9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BNC9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BNC9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BNC9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BNC9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BNC9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BNC9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BNC9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BNC9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BNC9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BNC9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BNC9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3BNC9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3BNC9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BNC9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BNC9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BNC9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BNC9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BNC9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms