Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8VRH5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8VRH5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8VRH5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8VRH5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8VRH5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8VRH5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8VRH5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8VRH5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8VRH5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8VRH5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8VRH5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8VRH5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8VRH5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
F8VRH5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8VRH5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8VRH5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8VRH5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8VRH5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8VRH5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8VRH5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8VRH5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8VRH5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8VRH5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8VRH5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8VRH5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8VRH5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8VRH5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
F8VRH5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
F8VRH5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
F8VRH5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8VRH5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8VRH5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8VRH5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8VRH5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8VRH5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8VRH5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8VRH5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8VRH5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8VRH5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8VRH5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8VRH5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8VRH5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8VRH5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
F8VRH5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8VRH5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8VRH5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8VRH5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
F8VRH5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8VRH5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8VRH5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8VRH5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8VRH5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8VRH5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8VRH5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8VRH5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8VRH5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8VRH5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8VRH5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8VRH5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8VRH5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8VRH5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8VRH5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8VRH5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8VRH5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8VRH5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8VRH5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8VRH5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8VRH5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8VRH5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8VRH5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8VRH5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8VRH5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8VRH5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8VRH5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8VRH5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8VRH5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8VRH5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8VRH5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
F8VRH5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
F8VRH5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
F8VRH5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
F8VRH5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms