Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PQ18 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PQ18 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PQ18 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PQ18 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PQ18 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PQ18 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PQ18 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PQ18 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PQ18 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PQ18 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PQ18 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PQ18 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PQ18 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PQ18 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PQ18 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PQ18 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PQ18 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PQ18 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PQ18 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PQ18 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PQ18 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PQ18 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PQ18 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PQ18 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PQ18 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PQ18 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PQ18 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PQ18 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PQ18 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PQ18 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PQ18 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PQ18 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PQ18 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PQ18 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PQ18 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PQ18 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PQ18 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PQ18 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PQ18 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PQ18 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PQ18 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PQ18 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PQ18 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PQ18 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PQ18 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PQ18 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PQ18 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PQ18 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PQ18 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PQ18 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PQ18 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E9PQ18 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E9PQ18 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E9PQ18 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E9PQ18 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PQ18 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PQ18 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PQ18 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PQ18 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PQ18 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PQ18 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PQ18 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PQ18 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PQ18 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PQ18 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PQ18 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PQ18 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PQ18 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PQ18 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PQ18 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PQ18 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PQ18 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PQ18 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PQ18 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PQ18 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PQ18 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PQ18 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PQ18 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PQ18 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PQ18 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PQ18 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PQ18 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PQ18 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PQ18 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PQ18 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PQ18 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PQ18 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PQ18 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PQ18 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PQ18 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PQ18 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PQ18 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PQ18 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PQ18 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PQ18 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PQ18 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PQ18 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PQ18 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PQ18 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms