Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms