Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCHNA4D1U4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCHNA4D1U4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms