Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF567-204ENST00000588311 2042 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSIP1-205ENST00000397519 1664 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC112719.2-201ENST00000501239 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL121956.1-201ENST00000444219 1548 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016355.1-201ENST00000604760 1533 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 FCGR3A-204ENST00000436743 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR1J2-201ENST00000335302 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR548XHG-201ENST00000355189 673 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL021068.1-201ENST00000392097 911 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 WISP3-205ENST00000409166 953 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL035250.1-201ENST00000424662 593 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00160-201ENST00000430635 693 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00158-203ENST00000440205 740 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEURL1-AS1-201ENST00000447820 439 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00635-204ENST00000466155 604 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC114786.3-201ENST00000509304 705 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms