Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EYA3Q99504 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms