Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms