Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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USP46P62068 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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USP46P62068 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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USP46P62068 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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USP46P62068 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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USP46P62068 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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USP46P62068 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP46P62068 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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