Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms