Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms