Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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COPS3Q9UNS2 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COPS3Q9UNS2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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