Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms