Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARHGAP28Q9P2N2 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms