Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FANCFQ9NPI8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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