Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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