Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms