Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms