Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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