Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms