Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HECW1Q76N89 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HECW1Q76N89 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HECW1Q76N89 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HECW1Q76N89 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HECW1Q76N89 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HECW1Q76N89 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HECW1Q76N89 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms