Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms