Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA3P32297 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA3P32297 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.4 ms