Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJB2P29033 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJB2P29033 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJB2P29033 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJB2P29033 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJB2P29033 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJB2P29033 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJB2P29033 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJB2P29033 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJB2P29033 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJB2P29033 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJB2P29033 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms