Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TREX2Q9BQ50 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms