Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC080013.1-204ENST00000607426 2185 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC018645.3-201ENST00000628855 2646 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LSAMPQ13449 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LSAMPQ13449 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LSAMPQ13449 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LSAMPQ13449 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LSAMPQ13449 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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LSAMPQ13449 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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