Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 WISP3-201ENST00000230529 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 VTA1-201ENST00000367621 1284 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 MMP26-202ENST00000380390 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 LINC01718-201ENST00000441660 391 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC126471.1-201ENST00000550676 362 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AL445223.1-201ENST00000595998 1051 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC127071.1-201ENST00000624997 712 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 CBR3-AS1-217ENST00000625079 743 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 LINC02533-201ENST00000563079 2272 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 MRPS31-201ENST00000323563 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 ANXA3-209ENST00000512884 1335 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 NAP1L1-213ENST00000548044 1339 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 TAS2R2P-201ENST00000421146 910 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 CLCN3P1-201ENST00000423965 1017 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC006013.1-201ENST00000424888 758 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC103563.6-201ENST00000432787 295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RPL35P5-201ENST00000433398 370 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC074121.1-201ENST00000441836 348 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RPL7P21-201ENST00000478287 635 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms