Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT74Q96LB3 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms