Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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