Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms