Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAMSAP2Q08AD1 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAMSAP2Q08AD1 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms