Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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ACTBP60709 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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ACTBP60709 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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ACTBP60709 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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ACTBP60709 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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ACTBP60709 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ACTBP60709 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ACTBP60709 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ACTBP60709 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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