Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms