Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms