Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PPIFP30405 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PPIFP30405 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PPIFP30405 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PPIFP30405 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PPIFP30405 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PPIFP30405 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PPIFP30405 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms