Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
O00370 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
O00370 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
O00370 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
O00370 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
O00370 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
O00370 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
O00370 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
O00370 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
O00370 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
O00370 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
O00370 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
O00370 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
O00370 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
O00370 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
O00370 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
O00370 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
O00370 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
O00370 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
O00370 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms