Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms