Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XAB2Q9HCS7 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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